Het Avengers Initiative was een in 2009 opgezet project om een speciaal team van personen met speciale krachten te vormen om de Verenidge Staten te beschermen van gevaren van binnen en buiten af. Het team zou The Avengers gaan heten, maar het project werd door de World Security Council ontbonden in 2011.
Geschiedenis
S.H.I.E.L.D. hield Tony Stark in de gaten toen hij gevangen werd genomen door de Ten Rings. Na Tony Stark zijn ontsnapping uit Afghanistan werd er een team onder leiding van Agent Coulson naar hem gestuurd om hem te spreken over 'Iron Man'. Ook arresteren ze Obadiah Stane en verzinnen ze een verhaal voor wat er was gebeurd tussen Iron Man en Iron Monger. Stark verteld echter op een persconferentie dat hij Iron Man is. Directeur Nick Fury bezoekt daarna Stark persoonlijk en vraagt hem om de consultant te worden van de Avengers Initiative, dit weigert Stark. S.H.I.E.L.D. stuurt daarom Agent Romanoff undercover, als de nieuwe assistent van Stark, naar zijn huis. Na een dronken avond van Stark, toen hij zijn huis had vernield, zochten Nick Fury en Agent Romanoff, nu als agent van S.H.I.E.L.D., hem op. Nick Fury geeft Tony een videoboodschap van zijn vader uit 1978. Door deze boodschap ontdekt Tony dat de opzet van de Stark Expo uit 1978 eigenlijk een blauwdruk is van een nog onbekend element, dat zijn leven kan redden. Ook wordt Agent Coulson aangesteld om Stark in de gaten te houden. Stark lost zijn probleem op met zijn Arc Reactor en organiseert een Stark Expo, waar hij in gevecht komt met Justin Hammer, Ivan Vanko en zijn Drones. Agent Romanoff infiltreert Hammer Industries en schakelt Vanko zijn macht uit, waardoor Stark hem kan doden. Hammer wordt vervolgens gearresteerd. Agent Romanoff keert terug naar S.H.I.E.L.D. en overhandigd de data die ze in Hammer Industries heeft buit gemaakt. Daarna wordt ze door Fury naar New York gestuurd om Bruce Banner, beter bekend als The Hulk, in de gaten te houden. Ze meld dat hij is veranderd in The Hulk, en wordt vervolgens naar Empire State University gestuurd omdat General Ross Fury heeft gemeld dat hij Banner gaat oppakken. Ze arriveert te laat en ziet dat Banner in de helicopter wordt meegenomen door Ross. Ze wordt naar binnen gestuurd door Fury om te zorgen dat Banner niets heeft achter gelaten voor Dr. Samuel Sterns. Ze treft Dr. Sterns, sterk gemuteerd door het bloed van The Hulk, aan en belt S.H.I.E.L.D. om een schoonmaak team te sturen. Dr. Sterns wordt meegenomen naar het hoofdkwartier en onderzocht onder de naam 'Project Mr. Blue'. Agent Romanoff wordt vervolgens naar Azië gestuurd. Fury stelt Tony Stark aan als consultant van de Avengers Initiative. Ondertussen wil de World Security Council dat Emil Blonsky lid wordt van The Avengers. Stark wordt naar General Ross gestuurd om te zorgen dat hij Blonsky niet vrij laat. Ze ontmoeten elkaar in een bar en Ross raakt zo geïrriteerd van Stark dat hij Blonksy niet vrij laat.